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9月12日，菲律宾总统杜特尔特表示，美军应撤出菲律宾南部地区。

菲律宾总统府５日发表声明说，菲总统杜特尔特签发总统令，于当天宣布菲律宾全国处于“紧急状态”。

菲律宾各方力量在该国南部爆发冲突时已击毙3名疑似伊斯兰国的恐怖分子。然而，尚未逮捕了穆罕默德·加法尔·马吉德（Mohammad Jaafar S.Maguid）。

8月12日，印度尼西亚军方发言人苏拉伊曼（Tatang Sulaiman）表示，印尼国民军（TNI）已决定成立一组特种部队，为解救被菲律宾阿布沙耶夫武装分子绑架的印尼人质做好准备。

马来西亚总理纳吉布·拉扎克（Najib Razak）和印度尼西亚总统佐科•维多多（Joko Widodo）下发指示，要求两国特派员在解决双方领土主权争端做出更大努力，同时在领土划分问题上向特派员提出新要求。

印尼国防部长雷亚库都提出出动军队，护送途经危险海域抵达菲律宾各艘船只的建议。

马来西亚警方7月10日透露，三名印尼船员在马来西亚海域被持枪武装分子绑架。

6月28日，印度尼西亚国防部长里亚米萨德·里亚古都（Ryamizard Ryacudu）表示，菲律宾政府同意准许印尼军队进入菲海域和领土参与营救上周在菲律宾海域被绑架的7名印尼船员。

菲律宾一位军方情报官员透露，曾宣称为中东“伊斯兰国”极端组织（IS）而战的东南亚武装分子6月23日公布，他们已选择菲律宾头号通缉犯之一作为“伊斯兰国”东南亚地区分支的头目。

6月20日，菲律宾、印度尼西亚和马来西亚三国防长一致同意采取协调步骤，其中包括展开海上和空中的联合巡逻行动，联手打击海上绑架及武装抢劫等犯罪活动，尤其是阿布沙耶夫（Abu Sayyaf）武装分子制造的恐怖袭击及绑架勒索案件。

马来西亚政府5月21日发表声明称，该国警方已经抓获疑似与“伊斯兰国（IS）”恐怖组织有关的十四名嫌犯。

今年4月份遭菲律宾恐怖组织阿布沙伊夫绑架的4名印尼船员于5月11日获释。

印尼、马来西亚和菲律宾三国军队指挥官和外交部长将出席于5月5日在印尼举行的会议，就在地区内海盗猖獗加剧的背景下加强航行安全问题进行讨论。

4月28日，菲军方发言人称，继1名加拿大人在菲国南部惨遭恐怖分子斩首后，菲律宾军方在南方宾苏禄（Sulu）省扫荡行动中，至少击毙14名阿布沙伊夫（Abu Sayyaf）恐怖分子。

菲律宾城府承诺将杀害加拿大人质约翰·里兹德尔（John Ridsdel）的凶手——极端组织“阿布沙耶夫”绳之以法。

4月25日，菲律宾总统阿基诺三世已下令要求安保力量加强对菲律宾极端组织“阿布沙耶夫”打击力度，以解救被该组织劫持的4名人质。

菲政府军当天在南部的巴西兰省击毙13名“阿布沙耶夫”团伙武装分子，2名政府军士兵在双方交火过程中阵亡，其他10名士兵受伤。

菲律宾政府军9日在菲国南部的苏禄省与阿布沙耶夫反政府武装再度交火，已造成双方共8人死亡，25人受伤。

菲律宾军方25日说，政府军当天在南部与阿布沙耶夫武装交火，造成至少７人死亡，另有23人受伤。

菲律宾警方23日说，菲南部城市三宝颜当天下午发生一起汽车炸弹袭击事件，造成至少1人死亡，48人受伤。